Bölge Müdürlüğümüz 22.12.2011 tarih ve 28150 sayılı Resmi Gazete'de yayımlanan 29.11.2011 tarih ve 2011/2474 sayılı Bakanlar Kurulu Kararı ile kurulmuş olup Yavuz Mah. Selahattin İçli Sok. No:3 Süleymanpaşa Tekirdağ adresinde hizmet vermektedir.

Bölge Müdürlüğümüz Tekirdağ ve Çanakkale illeri bağlanmıştır. Bölge Müdürlüğümüz denetiminde 28 liman ve iskele bulunmaktadır.

Bölge Müdürlüğümüz binasında Tekirdağ Gümrük Müdürlüğü ve Tekirdağ Gümrük Muhafaza Kaçakçılık ve İstihbarat Müdürlüğü ve Tekirdağ Ticaret İl Müdürlüğü ile beraber aynı bina da hizmek vermektedir.